Перепланировка ипотеке

Добрый день Сергей.

Комментарии под текстом:

Квартира куплена в ипотеку, дом сдан, акт приёма-передачи подписан, но до сих пор дом не поставлен на кадастровый учет. 
- понятно

Хотим сделать небольшую перепланировку, а именно: 
1. Из кладовки, смежной с с/у, сделать второй с/у. 
- если вход в кладовку из коридора, то возможно, если из жилой комнаты то нет

2. Выстроить подоконную часть в проёме между кухней и лоджий, сейчас там панорамные остекление в пол. 
- я не знаю конструктива дома, но потенциально в большинстве случаев возможно

3. Сдвинуть входную дверь немного в сторону.
- здесь сложность, скорее всего нет.

Возможно ли все это согласовать до момента постановки дома на кадастровый учёт
- не возможно

или возможно осуществить все переделки, а согласовать уже после.
- ну там как уж получиться. Если говорить принципиально, то да, согласовать перепланировку если все укладывается в нормы, возможно и после ее выполнения. И в вашем случае исходные данные кроме переноса входной двери хорошие. Но к сожалению гарантии согласования дать под выполненный ремонт я не могу.