Вопрос по узаканиванию перестройке квартиры в частном доме

Добрый день!
У меня есть дачный дом на троих с соседями.
При его оформлении в 2000 году его разделили на 3 квартиры с определением на плане границ.
В 2014 Мы достроили над своей частью второй этаж и новую крышу, хотели оформить как реконструкцию по дачной амнистии.
Получили отказ с основанием, что в свидетельстве указан не дом, а квартира.
И необходимо проводить оформление, как говорит Регистратор, применяются нормы Жилищного кодекса, а не Градостроительного кодекса как для дачных, садовых домов с дачной амнистией до 01.03.19 г.
В связи с этим необходим проект переустройства и акт приемки
вы возьметесь помочь? и какова будет стоимость решения данного вопроса?