Перепланировка в трёшке

Добрый день Светлана.

Для объективного ответа не достаточно информации.
Но попробую расписать по вариантам.
Есть да нарушения
1. Выход из санузла в кухню. Да, будет так считаться. Так как кухней будет считаться помещение прямо от двери из коридора.
2. Расширение туалета за счет кухни.

Итак:
Если квартира расположена на первом этаже, или на втором, но ниже расположено нежилое помещение, то расширение туалета за счет кухни согласовать будет возможно. 
Если же под вашей квартирой такая же кваритра то не возможно.

Выходи из санузла и ванной в кухню от этажа не зависит, это в принципе нарушение.

Что возможно сделать.
1. Необходимо ставить дверь в месте которое я показал на картинке и тогда не будет считаться что выход из ванной и санузла в кухню. Либо убирать стену и дверь и стену в коридоре.
2. Необходимо ставить стену, что бы отгородить расширение санузла на кухню, в случае если под вами квартира.

Остальные мероприятия согласуемы.